- Instituto de Estudios Ambientales y Desarrollo Rural de la Llanura Chaqueña – Sede Central
- Instituto para el desarrollo del árido y semiárido (INDEAS)
- Instituto de ciencias químicas (ICQ)
- Instituto de ciencia y tecnología de alimentos (ICyTA)
- Centro de investigaciones apícolas
- Instituto de estudios sociales para el desarrollo (INDES)
- Instituto de investigación de derecho del mercosur comunitario y comparado (INDERMERC)
- Instituto interdisciplinario y regional de investigación y estudios en gerontología (IIRGe)
- Instituto de estudios para la administración pública (IDEAP)
- Centro de estudios de demografía y población (CEDEP)
- Centro de estudios en ciencias económicas (CECE)
- Centro de investigaciones y estudios en educación superior (CIEES)
- Centro de servicios en lenguas extrangeras (CESELEX)
- Centro de estudios y políticas para el niño y el adolescente (CEPNA)
- Instituto de recursos hídricos
- Instituto de materiales, estructuras y construcciones
- Instituto de protección vegetal (INPROVE)
- Instituto de silvicultura y manejo (INSIMA)
- Instituto tecnológico de la madera (ITM)
- Jardín botánico